熱制御系の役割は、衛星構体及び搭載機器の温度を適正な範囲に保つことです。熱の観点からのShindaiSatの特徴として、ミッション機器であるＬＥＤ近傍が高温になることが挙げられます。 可視光通信実験中は、衛星上面（地球指向面）のＨｉｇｈＧａｉｎＬＥＤが全数点灯し、ＬＥＤ素子及び近傍の部材の温度が高くなります。熱の観点からミッション機器を安全に運用するためには、これらの温度を熱解析により事前に十分把握しておくことが重要です。