| 財務部長 | 内部監査室 |
| 学長府 |
| 総務部 |
| 財務部 |
| 研究推進部 |
| 環境施設部 |
| アクア・リジェネレーション機構（松本キャンパス） |
| 総合健康安全センター |
| 環境マインド推進センター |
| 地域防災減災センター |
| グリーン・ウェルビーイングセンター |
| 信州地域技術メディカル展開センター |
| オープンベンチャー・イノベーションセンター |
| 遺伝子・細胞治療研究開発センター |
| アクア・リジェネレーション共創研究センター |
| 信大クリスタルラボ |
| 共創研究クラスター(各共創研究所を含む。) |
| 学務部長 | 学務部 |
| 全学教育センター |
| 教育基盤構築センター |
| 学生総合支援センター |
| 国際部長 | グローバル化推進センター |
| 附属図書館長 | 附属図書館 |
| 人文学部長 | 人文学部 |
| 総合人文社会科学研究科(松本キャンパス(経法学部長(物品供用役)の物品管理を除く。)) |
| 教育学部長 | 教育学部 |
| 総合人文社会科学研究科(長野(教育)キャンパス) |
| 教育学研究科 |
| 経法学部長 | 経法学部 |
| 総合人文社会科学研究科(松本キャンパス(人文学部長(物品供用役)の物品管理を除く。)) |
| 社会実装研究クラスター社会基盤研究所 |
| 理学部長 | 理学部 |
| 総合理工学研究科(松本キャンパス) |
| 総合医理工学研究科(松本キャンパス(医学部長(物品供用役)の物品管理を除く。)) |
| 医学部長 | 医学部 |
| 医学系研究科 |
| 総合医理工学研究科(松本キャンパス(理学部長(物品供用役)の物品管理を除く。)) |
| 社会実装研究クラスターバイオメディカル研究所 |
| 基盤研究支援センター生命科学分野動物実験支援部門，機器分析分野機器分析支援部門及びRI実験分野RI実験支援部門 |
| 医学部附属病院長 | 医学部附属病院 |
| 工学部長 | 工学部 |
| 総合理工学研究科(長野(工学)キャンパス) |
| 総合医理工学研究科(長野(工学)キャンパス) |
| 基盤研究支援センター機器分析分野機器分析支援部門長野(工学)分室 |
| 社会実装研究クラスター次世代空モビリティシステム研究拠点 |
| 社会実装研究クラスター応用微生物学ルネサンスセンター |
| 国際科学イノベーションセンター |
| アクア・リジェネレーション機構(長野(工学)キャンパス) |
| 農学部長 | 農学部 |
| 総合理工学研究科(伊那キャンパス) |
| 総合医理工学研究科(伊那キャンパス) |
| 基盤研究支援センター機器分析分野機器分析支援部門伊那分室 |
| 社会実装研究クラスター山岳科学研究所 |
| アクア・リジェネレーション機構(伊那キャンパス) |
| 繊維学部長 | 繊維学部 |
| 総合理工学研究科(上田キャンパス) |
| 総合医理工学研究科(上田キャンパス) |
| 基盤研究支援センター生命科学分野遺伝子実験支援部門及び機器分析分野機器分析支援部門上田分室 |
| 社会実装研究クラスター繊維科学研究所 |
| アクア・リジェネレーション機構(上田キャンパス) |
| 情報基盤センター長 | 情報基盤センター |