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教員氏名
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林 哲也
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所属・職名
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九州大学大学院医学研究院基礎医学部門病態制御学講座細菌学分野 教授
信州大学医学部メディカル・ヘルスイノベーション講座 客員教授
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研究分野
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ゲノム科学、病原細菌学
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学会活動
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日本細菌学会(評議員)、日本ゲノム微生物学会(評議会議長)、
ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)推進委員会委員、
ゲノムテクノロジー第164委員会委員、その他
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研究紹介
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(1) 病原性大腸菌やリケッチアをはじめとする種々のヒト病原細菌のゲノム解析と病原性の解明
(2) ゲノム解析を基盤とする動物感染症の研究（家畜感染症を中心に）
(3) 感染症の疫学・臨床診断へのゲノム解析の応用
(4) ヒトおよび動物の常在細菌叢のゲノム解析
(5) 新学術研究「ゲノム支援」を通じた我が国のゲノム研究支援（微生物ゲノム解析拠点として活動）
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＜主な業績＞
- T. Hayashi, et al.: Complete genome sequence of enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 and genomic comparison with a laboratory strain K-12. DNA Res., 8: 11-22, 2001 (Supplement 8: 47-52, 2001).
- T. Ooka,et al.: Inference of the impact of insertion sequence (IS) elements on bacterial genome diversification through analysis of small-size structural polymorphisms in Escherichia coli O157 genomes. Genome Res. 19:1809-1816, 2009.
- Y. Ogura, et al.: Comparative genomics reveal the mechanism of the parallel evolution of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106: 17939-17944, 2009.
- M. Kusumoto, et al.: IS-excision enhancer removes transposable elements from bacterial genomes and induces various genomic deletions. Nat. Commun., 2:152, DOI:10.1038/ncomms1152. 2011.
- M. Arumugam, et al.: Enterotypes of the human gut microbiome. Nature, 473: 174-180, 2011.